1. Teoretické štúdium interakcií mezi receptorom VEGFR2 a vybranými inhibítormi
| Title | Teoretické štúdium interakcií mezi receptorom VEGFR2 a vybranými inhibítormi |
|---|---|
| Par.title | Theoretical study of intermolecular interactions between VEGFR2 and selected inhibitors |
| Author info | Šimon Budzák, Miroslav Medveď, Marek Skoršepa |
| Author | Budzák Šimon 1982- (34%) UMBFP08 - Katedra chémie |
| Co-authors | Medveď Miroslav 1971- (33%) UMBFP08 - Katedra chémie Skoršepa Marek 1976- (33%) UMBFP08 - Katedra chémie |
| Source document | Mladí vedci 2009 : zborník vedeckých prác doktorandov a mladých vedeckých pracovníkov. CD-ROM, s. 262-268. - Nitra : Univerzita Konštantína Filozofa, Fakulta prírodných vied, 2009 / Rózová Zdenka ; Stawarz Robert |
| Keywords | VEGFR2 receptor inhibítory interakčná energia - energia ONIOM metóda inhibitors interaction energy ONIOM method |
| Language | Slovak |
| Country | Slovak Republic |
| Annotation | V našej práci sme sa zaoberali možnosťami inhibície receptora VEGFR2( vascular endothelial growth factor receptor 2). Spájaním fragmentov z dvoch známych inhibítorov (1Y6A a 1YWN), pomocou dvoch druhov linkerov sme vytvorili sériu nových potenciálnych inhibítorov. Metódou ONIOM (AM1:B3LYP/6-31G*) sme určili interakčné energie jednotlivých inhibítorov a ich fragmentov. Zistili sme, že inhibítor 1YWN je k receptoru VEGFR2 viazaný asi o 35% silnejšie než 1Y6A. Vloženie oboch fragmentov spoločne do aktívneho miesta vedie k nárastu interakčnej energie približne na úrovni ich súčtu ich interakčných energií. Štruktúra interakčného regiónu spolu s inhibítorom zistená našimi výpočtami nezodpovedá (na úrovni interakčných energií) experimentálnym údajom. Optimálna dĺžka linkera spájajúceho oba fragmenty je podľa našich výpočtov rovná dĺžke reťazca zloženého z piatich atómov |
| Public work category | AED |
| No. of Archival Copy | 11627 |
| Catal.org. | BB301 - Univerzitná knižnica Univerzity Mateja Bela v Banskej Bystrici |
| Database | xpca - PUBLIKAČNÁ ČINNOSŤ |